Στην υπόθεση του Γιάννη Παναγόπουλου εμπλέκεται εμμέσως μια πρώην Γενική Γραμματέας του υπουργείου Εργασίας, το όνομα της οποίας έχει συνδεθεί και στο παρελθόν με αντίστοιχες υποθέσεις και κοινοτικά κονδύλια. Η εν λόγω κυρία, η οποία παρέμενε στη θέση της όσες κυβερνήσεις κι αν άλλαζαν, φέρεται να έδειχνε τις προτιμήσεις της σε συγκεκριμένες εταιρείες και πρόσωπα.
